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中国科学家揭示新冠病毒与SARS病毒有何不同 古朵新闻√

发布时间:2020-03-16 阅读:52

中国医学科学院、中国疾病预防控制中心等机构的研究人员近日对新发现的冠状病毒(2019-nCoV)基因组进行了深入注释,发现新型冠状病毒SARS或类SARS冠状病毒存在一些差异。

在这项发表于《Cell Host & Microbe》杂志上的新研究中,研究人员对新型冠状病毒与SARS病毒和类SARS病毒进行了系统比较,鉴定出这些冠状病毒之间的380个氨基酸替换,而这些替换可能引起了新型冠状病毒的功能性和致病性差异。

冠状病毒在遗传上分为四个属:α冠状病毒,β冠状病毒,γ冠状病毒和δ冠状病毒。之前已鉴定出六种人类冠状病毒,包括HCoV-NL63和HCoV-229E,它们属于α冠状病毒属;以及HCoV-OC43、HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV,它们均属于β冠状病毒属。

 

研究人员指出,冠状病毒的基因组大约在26,000至32,000个碱基的范围内,包括6-11个开放阅读框(ORF)。第1个ORF约占整个基因组的67%,编码16个非结构蛋白,而其余的ORF则编码辅助蛋白和结构蛋白。四个主要的结构蛋白是刺突糖蛋白(S)、小包膜蛋白(E)、基质蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)。其中,刺突蛋白在病毒与宿主细胞的结合中起着至关重要的作用,并决定了宿主的向性。SARS-CoV和MERS-CoV的刺突蛋白通过不同的受体结合结构域与不同的宿主受体结合。


在这项研究中,研究人员对三个zui先测定的新型冠状病毒基因组(HB01、HB04和HB05)进行了深入的基因组注释,并将它们与相关的冠状病毒进行了比较,包括1,008株人SRAS冠状病毒、338株蝙蝠类SARS冠状病毒和3,131株人MERS冠状病毒。


 

 

在氨基酸水平上,研究人员发现新型冠状病毒与SARS病毒非常相似,但也有一些显著差异。例如,8a蛋白在SARS病毒中存在,但在新型冠状病毒中却不存在。8b蛋白在SARS病毒中有84个氨基酸,但在新型冠状病毒中有121个氨基酸。“目前还需要进一步的研究来鉴定这些差异如何影响新型冠状病毒的功能性和致病性,”


根据各种病毒全基因组的系统发育分析,研究人员发现新型冠状病毒与MERS、SARS和类SARS冠状病毒处于同一冠状病毒进化枝上,但新型冠状病毒与蝙蝠类SARS冠状病毒的相似度zui高,而与MERS冠状病毒的亲缘关系较远。这些结果与之前发表的研究结论相似。


然而,尽管对全基因组和单个基因的系统发育分析明确表明新型冠状病毒与蝙蝠类SARS冠状病毒的亲缘关系zui近,但研究人员表示,他们还没有找到蝙蝠病毒的单个毒株,其中所有蛋白质都与新型冠状病毒的对应物高度相似。


“考虑到新型冠状病毒与SARS病毒和类SARS蝙蝠病毒之间的亲缘关系,分析不同蛋白质的氨基酸替换有望揭示新型冠状病毒在结构和功能上与SARS病毒有何不同,”

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